本网消息(文/向黎)近期,第十五届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛在上海大学落下帷幕。成都大学信息科学与工程学院“基于GPU高速运算的分子动力学模拟:以肺癌靶向药物耐药研究为例”项目荣获第十五届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛三等奖。
第十五届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛由共青团中央、中国科协、教育部、中国社科院、全国学联、上海市人民政府主办,上海大学承办。
本次获奖作品将计算机科学与生命科学相结合,部署基于GPU(Graphics Processing Unit)加速运算的分子动力学模拟软件体系,实现运算速度指数级增长,并以非小细胞肺癌中高频突变的ALK(Anaplastic Lymphoma Kinase)激酶蛋白的第1156位半胱氨酸和第1198位亮氨酸(C1156YL1198)双突变引起的肺癌靶向耐药为研究对象,对该计算生物学体系进行了系统验证。此项研究充分实现计算机科学与生命科学之间的学科交叉,为科学问题的解决带来新的机遇;搭建基于GPU高速运算的计算生物学平台,大大提高对复杂分子体系的运算处理能力,并以“ALK-抑制剂”体系为模型进行验证;阐明ALK靶向药物耐药性产生的分子机制,对新一代ALK抑制剂的设计具有重要理论指导意义。